La situation au Moyen-Orient exige des partenaires œcuméniques qu’ils unissent leurs efforts pour établir la paix et la justice au niveau local, national, régional et international. La région est confrontée à des problèmes graves: occupation armée de territoires, déni des droits de la personne et des aspirations nationales, non-application de l’état de droit, diverses formes d’extrémisme et d’intolérance, prolifération nucléaire ou encore mainmise sur les ressources énergétiques.
Le COE accompagne ses Églises membres dans la région, notamment en Égypte, en Syrie et en Irak, où les violences et les tragédies récentes ont mis en danger la présence et le témoignage de la population chrétienne. Le COE n’oublie pas non plus le conflit israélo-palestinien et soutient les résolutions des Nations Unies et les efforts en vue de son règlement juste et pacifique.
Lancé en août 2002, le Programme œcuménique d’accompagnement en Palestine et en Israël (EAPPI) du COE accompagne les populations palestiniennes et israéliennes dans leurs actions non violentes et leurs initiatives concertées de défense des causes pour mettre fin à plus de cinquante ans d’occupation israélienne en Palestine.